Η Κνωσσός αποτελεί τον χώρο του πιο σημαντικού και ευρέως γνωστού παλατιού του Μινωικού πολιτισμού.
Σύμφωνα με την παράδοση, υπήρξε το παλάτι του θρυλικού βασιλιά Μίνωα. Το παλάτι αυτό, παγκοσμίως γνωστό ως το Παλάτι της Κνωσσού, συνδέεται με μεγάλους μυθικούς θρύλους, όπως τον Λαβύρινθο με τον Μινώταυρο και την ιστορία του Δαίδαλου με τον Ίκαρο.
Ο χώρος κατοικούνταν από την Νεολιθική περίοδο μέχρι και την Ρωμαϊκή εποχή. Αναφέρεται η πόλη ως ko-no-so στις ταμπλέτες της Γραμμικής Β του 14ου αιώνα Π.Χ.
Εντεταμένη κατοίκηση συνέβη περισσότερο κατά την διάρκεια της Μινωικής περιόδου, όταν τα περίφημα πρώτα παλάτια (19ος-17ος αιώνας Π.Χ.) και τα δεύτερα παλάτια (16ος-14ος αιώνας Π.Χ.) χτίστηκαν μαζί με άλλα κτίρια όπως ξενώνες και πολυτελή σπίτια. Μετά την επί μέρους καταστροφή της το 1450 Π.Χ., η Κνωσσός αποικίστηκε από Μυκηναίους της Ελλάδος. Η πόλη άνθισε ξανά κατά την διάρκεια της Ελληνιστικής περιόδου, (ναοί των Γλαυκών και του Δημητρίου, μαυσονεία, το βόρειο κοιμητήριο και τα αμυντικά οχυρά) και το 67 Π.Χ. την κατέβαλλαν οι Ρωμαίοι. Η Βίλα του Διόνυσου, ένα ιδιωτικό σπίτι με εξαιρετικά μωσαϊκά, χτίστηκε την ίδια περίοδο.